Siden oktober 2015 har Kerteminde Maritime Haver haft en samarbejdsaftale med Fjordbiologisk Laboratorium (SDU) i Kerteminde. Laboratoriet udlåner materialer til Kerteminde Maritime Haver, som til gengæld giver laboratoriets forskere adgang til en del af anlægget til benyttelse som "marin forskningspark". Et samarbejde som er meget betydningsfuldt for begge parter.
